86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3046 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  69.89 
 
 		 273 aa  414  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  64.44 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  64.04 
 
 		 273 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  63.33 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  63.7 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  61.85 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  61.85 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  62.59 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  62.64 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  62.41 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  62.78 
 
 		 271 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  63.7 
 
 		 286 aa  350  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  60.23 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  60.54 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  64.04 
 
 		 285 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  50 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  33.7 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  36.13 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.96 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  33.09 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.92 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.58 
 
 		 599 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  29.26 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  28.09 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  32.35 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.33 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  27.49 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.98 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.52 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.97 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  29.1 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.96 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.56 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  30.61 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.59 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  30.37 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  29.37 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.9 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.08 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  24.82 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.45 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30.12 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  26.47 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  27.84 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  29.22 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  24.36 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  28.46 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  23.02 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  25.3 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  23.67 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  24.4 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  24.9 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  25.41 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  25.41 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  25.41 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  23.49 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  24.16 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  28.02 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  28.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  30.84 
 
 		 461 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  22.92 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.53 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.21 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  26.74 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  25.45 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.3 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.81 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.32 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.78 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.56 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.53 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.98 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.71 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  30.77 
 
 		 505 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  24.73 
 
 		 667 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.46 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  24.34 
 
 		 232 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>