70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2696 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  100 
 
 
322 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  63.64 
 
 
326 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  56.52 
 
 
325 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  55.11 
 
 
325 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  54.49 
 
 
321 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  55.11 
 
 
321 aa  352  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  55.49 
 
 
320 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  55.49 
 
 
320 aa  349  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.31 
 
 
332 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  27.74 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  30.26 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  29.41 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  28.44 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  30.69 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  31.21 
 
 
285 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  29.73 
 
 
329 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.87 
 
 
285 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.14 
 
 
289 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.56 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.77 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  28.46 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  31.42 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  29.41 
 
 
271 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.87 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.41 
 
 
599 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  28.86 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.1 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  28.19 
 
 
283 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  27.97 
 
 
273 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  25.8 
 
 
276 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.53 
 
 
272 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.76 
 
 
300 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.52 
 
 
251 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  29.12 
 
 
273 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  28.52 
 
 
271 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  30.25 
 
 
276 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  25.89 
 
 
331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  29.37 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  26.69 
 
 
276 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.91 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.76 
 
 
272 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  26.72 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.25 
 
 
268 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  27.39 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30 
 
 
272 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  28.47 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  27.27 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  27.03 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  26.48 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.02 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  26.54 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  25.09 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  25.17 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  22.92 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  24.47 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  24.27 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  22.7 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  23.88 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  23.9 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  23.13 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  23.13 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  22.48 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  23.13 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  24.91 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  25.38 
 
 
261 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  23.33 
 
 
297 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  25.88 
 
 
590 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  23.23 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.2 
 
 
252 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>