More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3673 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3673  ribosomal protein S1  100 
 
 		 408 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3731  RNA binding S1 domain protein  97.77 
 
 		 537 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3814  RNA binding S1 domain protein  97.28 
 
 		 535 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3801  RNA-binding S1 domain-containing protein  82.96 
 
 		 527 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289517  normal  0.106411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  36.59 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0546  RNA binding S1 domain protein  40.65 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  36.39 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  37.01 
 
 		 472 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  36.39 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  38.73 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  35.34 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  36.52 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  33.68 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2122  30S ribosomal protein S1  34.78 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000709036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.73 
 
 		 677 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  35 
 
 		 579 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  37.5 
 
 		 487 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  32.96 
 
 		 573 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.14 
 
 		 654 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  33.6 
 
 		 564 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  31.87 
 
 		 571 aa  170  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.51 
 
 		 676 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.54 
 
 		 672 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 584 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 584 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  35.65 
 
 		 574 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.65 
 
 		 604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  34.17 
 
 		 387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  32.8 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  32.15 
 
 		 567 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  32.41 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  36.28 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  28.8 
 
 		 644 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  36.28 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  33.82 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6619  RNA binding S1 domain protein  32.7 
 
 		 630 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000014562  normal  0.0151044 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  35.96 
 
 		 561 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  32.07 
 
 		 557 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  33.06 
 
 		 562 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  32.05 
 
 		 561 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  32.07 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  33.06 
 
 		 562 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  31.67 
 
 		 575 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  33.78 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  30.97 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  31.64 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  33.06 
 
 		 564 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  32.86 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.49 
 
 		 661 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 586 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  31.38 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  33.06 
 
 		 564 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  35.86 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  32.86 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  32.86 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  31.34 
 
 		 558 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  31.32 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  31.32 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 547 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  32.06 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  31.34 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  30.86 
 
 		 609 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  33.43 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  32.84 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  31.51 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  31.51 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 571 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 577 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 589 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  30.62 
 
 		 570 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 570 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 576 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  31.27 
 
 		 504 aa  156  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  31.1 
 
 		 720 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  31.3 
 
 		 556 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  30.87 
 
 		 556 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  31.2 
 
 		 561 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  31.3 
 
 		 556 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 576 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 576 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  30.54 
 
 		 576 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  33.58 
 
 		 487 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>