More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2122 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2122  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 492 aa  1002    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000709036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  48.95 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  46.96 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  45.74 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  42.75 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  36.92 
 
 		 584 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  36.48 
 
 		 584 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  37.17 
 
 		 579 aa  272  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  34.47 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  36.12 
 
 		 570 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.94 
 
 		 577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  36.14 
 
 		 560 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  35.07 
 
 		 596 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  35.68 
 
 		 570 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 		 573 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 		 569 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 		 569 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  34.68 
 
 		 570 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  34.78 
 
 		 593 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  34.77 
 
 		 559 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  36.67 
 
 		 577 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  35.45 
 
 		 570 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  36.07 
 
 		 569 aa  259  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  36.07 
 
 		 569 aa  259  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  35.45 
 
 		 570 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  36.18 
 
 		 582 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  35.68 
 
 		 560 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 576 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 576 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  34.53 
 
 		 598 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 576 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 560 aa  256  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  33.85 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  32.78 
 
 		 562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  35.36 
 
 		 559 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 571 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  34.93 
 
 		 569 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  34.55 
 
 		 556 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  35.28 
 
 		 567 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 577 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  32.64 
 
 		 562 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 547 aa  252  9.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  37.34 
 
 		 584 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  32.37 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 558 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  33.95 
 
 		 559 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 560 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  36.06 
 
 		 573 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  33.62 
 
 		 561 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  33.04 
 
 		 564 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 566 aa  249  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  32.82 
 
 		 564 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  36.2 
 
 		 558 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 		 561 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  34.68 
 
 		 558 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  34.68 
 
 		 558 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  35.15 
 
 		 559 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  35.15 
 
 		 559 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  35.68 
 
 		 558 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  38.69 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  38.52 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  33.93 
 
 		 566 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  33.93 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 		 561 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 		 561 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  33.99 
 
 		 573 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  33.84 
 
 		 561 aa  246  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  33.41 
 
 		 558 aa  246  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  35 
 
 		 559 aa  246  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  33.41 
 
 		 558 aa  246  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  32.88 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  33.55 
 
 		 720 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  36.38 
 
 		 575 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  32.88 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 		 571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  33.56 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 556 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>