More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3814 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3673  ribosomal protein S1  96.81 
 
 		 408 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3731  RNA binding S1 domain protein  98.7 
 
 		 537 aa  794    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3814  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 535 aa  1032    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3801  RNA-binding S1 domain-containing protein  76.82 
 
 		 527 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289517  normal  0.106411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  36.83 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0546  RNA binding S1 domain protein  40.93 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  37.56 
 
 		 400 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  36.3 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  37.03 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  34.86 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  38.73 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  34.31 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.24 
 
 		 573 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2122  30S ribosomal protein S1  34.86 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000709036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  37.53 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.54 
 
 		 677 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  34.71 
 
 		 579 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.93 
 
 		 676 aa  170  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  34.69 
 
 		 654 aa  169  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.16 
 
 		 672 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 574 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  32.14 
 
 		 571 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 481 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  32.67 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.65 
 
 		 604 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  35 
 
 		 584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  35 
 
 		 584 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  36.91 
 
 		 561 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  36.91 
 
 		 561 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  33.66 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  33.66 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  33.93 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  33.66 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  32.74 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  36.59 
 
 		 561 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  32.53 
 
 		 584 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  33.42 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  31.64 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  33.66 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  31.88 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  33.59 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.53 
 
 		 661 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  31.75 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  31.38 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  32.42 
 
 		 515 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  33.94 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  35.6 
 
 		 427 aa  158  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6619  RNA binding S1 domain protein  31.76 
 
 		 630 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000014562  normal  0.0151044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  33.88 
 
 		 586 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  28.85 
 
 		 644 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 		 558 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  31.78 
 
 		 561 aa  157  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  29.82 
 
 		 609 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 		 558 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 		 558 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  32.33 
 
 		 558 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  34.03 
 
 		 492 aa  156  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  32.79 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  32.56 
 
 		 400 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  33.84 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  31.79 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  32.26 
 
 		 587 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  32.99 
 
 		 495 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  31.79 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  32.92 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  32.52 
 
 		 562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.43 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  31.87 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  32.52 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  33.94 
 
 		 488 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  30.92 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 589 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 		 599 aa  154  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  31.59 
 
 		 559 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 571 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  32.22 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  30.96 
 
 		 563 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  30.96 
 
 		 563 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 570 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 570 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 576 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 577 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  33.43 
 
 		 557 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>