More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1128 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 432 aa  847    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  59.72 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  59.26 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  59.39 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  59.39 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  58.02 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  54.01 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  58.02 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  55.15 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  54.82 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  54.82 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  54.82 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  76.76 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  75.54 
 
 		 337 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  75.54 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  75.54 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  60.14 
 
 		 317 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  62.68 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 333 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  57.53 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  60.81 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  61.87 
 
 		 318 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  63.83 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  63.64 
 
 		 320 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  61.87 
 
 		 330 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  55.03 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  50.84 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  55.71 
 
 		 338 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  60.14 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 		 315 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  54.23 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  51.7 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  54.68 
 
 		 309 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  46.81 
 
 		 304 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 308 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  46.94 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  48.57 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 312 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  43.65 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  53.9 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  49.66 
 
 		 353 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  45.06 
 
 		 309 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  49.21 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  48.82 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  44.85 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 		 324 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  53.79 
 
 		 313 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  52.35 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 382 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 387 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  46.71 
 
 		 306 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  46.04 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  49.64 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  45.86 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  47.86 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  48.2 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  53.1 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  47.24 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  50.39 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  42.5 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  46.76 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  45.37 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  42.22 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 		 319 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  46.04 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  43.64 
 
 		 376 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40 
 
 		 298 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  42.54 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.69 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  44.55 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.69 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  47 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  39.69 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  45.45 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.86 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.55 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>