More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0755 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  66.04 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  67.2 
 
 
318 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  66.35 
 
 
317 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  69.44 
 
 
318 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  68.39 
 
 
323 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  65.2 
 
 
330 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  65.79 
 
 
325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  63.58 
 
 
320 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  63.38 
 
 
333 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  53.8 
 
 
355 aa  341  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 
337 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 
337 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  56.59 
 
 
318 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  54.89 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  64.73 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  56.23 
 
 
308 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  51.13 
 
 
309 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  53 
 
 
337 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  55.48 
 
 
315 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  52.52 
 
 
317 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  53.77 
 
 
315 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  47.13 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
341 aa  268  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 
313 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  51.51 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  50.81 
 
 
309 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  48.87 
 
 
330 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  52.44 
 
 
331 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  47.46 
 
 
357 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  40 
 
 
394 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  46.79 
 
 
303 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  52.12 
 
 
299 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  46.71 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 
312 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 
404 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  42.06 
 
 
394 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  49.13 
 
 
309 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  45.75 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  51.27 
 
 
284 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  40.84 
 
 
353 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 
369 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  46.47 
 
 
316 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  47.28 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  42.86 
 
 
365 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  42.9 
 
 
333 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  70.71 
 
 
345 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  67.12 
 
 
426 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
339 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  48.61 
 
 
338 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  46.84 
 
 
324 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  66.44 
 
 
430 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 
434 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  64.47 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  65.73 
 
 
422 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  66.43 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  65.03 
 
 
422 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  65.03 
 
 
422 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  63.58 
 
 
434 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  42.09 
 
 
316 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  63.58 
 
 
434 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  62.91 
 
 
434 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  65.71 
 
 
427 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  65.71 
 
 
425 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 
312 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  44.79 
 
 
319 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  60.96 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  56.67 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 
362 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 
416 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 
421 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 
387 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.95 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.1 
 
 
312 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.1 
 
 
312 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.1 
 
 
312 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  53.54 
 
 
354 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  57.93 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 
302 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 
311 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
312 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 
359 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
340 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
346 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.12 
 
 
298 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
398 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
305 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
305 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 
352 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  38.05 
 
 
325 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 
325 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  30.13 
 
 
315 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>