More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4656 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 319 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  73.23 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  64.24 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  67.9 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  63.49 
 
 		 324 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  51.34 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  62.58 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  55.38 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  57.47 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  57.79 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  50.16 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  51.68 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  43.28 
 
 		 341 aa  258  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  38.48 
 
 		 421 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.11 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  39.35 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  48.22 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.46 
 
 		 368 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  45.81 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  40.97 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 		 318 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  46.54 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  47.81 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  45.86 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  45.89 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  46.79 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  72.97 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  45.14 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  49.52 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  47.76 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  45.65 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  44.55 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  47.96 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  42.68 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  46.62 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  38.55 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  44.2 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  44.65 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  48.09 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  48.06 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  65.49 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  56.55 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  57.86 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  53.1 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  51.8 
 
 		 427 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  57.72 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 426 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  51.8 
 
 		 422 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 434 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  51.08 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.92 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.73 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  28.09 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  28.09 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  26.48 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.77 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  29.39 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  25.81 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  25.81 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  25.81 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>