More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1698 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  100 
 
 		 337 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  55.32 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  53.9 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  51.11 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  53.25 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  53.82 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.11 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  44.58 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  51.81 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  50.78 
 
 		 355 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  51.71 
 
 		 332 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  53.99 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  41.27 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  54.83 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.6 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  53.4 
 
 		 318 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  49.04 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  52.15 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  49.53 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  45.31 
 
 		 312 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  49.23 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  49.23 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  49.23 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  51.27 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  46.39 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  51.72 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  51.28 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  53.5 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  44.69 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  48.31 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  45.13 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  49.49 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  50.77 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  45.95 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  45.31 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  51.31 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  50.53 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  35.75 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  50.52 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  49.04 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  47.42 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  43.18 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  47.81 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  46.18 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  45.22 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  47.47 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  50.61 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  53.33 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  50.67 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  50.67 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  51.39 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  55.03 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  57.93 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  46.63 
 
 		 434 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 434 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  52.45 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  47.53 
 
 		 434 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  47.53 
 
 		 434 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  52.52 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.78 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  46.79 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  47.65 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  28.89 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  28.89 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  28.89 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.86 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  52.48 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  36.13 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  24.7 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  31.38 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  31.08 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  31.08 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  31.08 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  31.08 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>