More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06410 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  56.92 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  57.52 
 
 		 325 aa  348  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  57.69 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  48.34 
 
 		 394 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  49.73 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  47.15 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  43.47 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  52.51 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  48.56 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 		 369 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  48.53 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  48.36 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.2 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  48.52 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  43.89 
 
 		 355 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  46.96 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  44.02 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  43.95 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  46.33 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  44.03 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  48.17 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  45.72 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  38.84 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  43.83 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  48.16 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  44.48 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  46.6 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.84 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  44.73 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  45.39 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  47.71 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  44.65 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  44.3 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  47.84 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  50.37 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  49.18 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  45.18 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  45.03 
 
 		 319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  45.72 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.38 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  69.44 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  47.45 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  71.43 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 404 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 394 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  50.71 
 
 		 427 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  47.89 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 425 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  51.43 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  50.72 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  50.71 
 
 		 422 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 422 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 		 434 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48.92 
 
 		 419 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.17 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.64 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  43.57 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  28.71 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  46.81 
 
 		 432 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  27.63 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  27.63 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.2 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  28.17 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.63 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  31.53 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>