More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2856 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  66.24 
 
 
315 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  64.57 
 
 
317 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  63.79 
 
 
315 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  67.33 
 
 
313 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  62.79 
 
 
331 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  55.8 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  61.72 
 
 
299 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  55.27 
 
 
317 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  52.87 
 
 
317 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 
325 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  54.84 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  54.46 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 
330 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  49.53 
 
 
355 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  55.99 
 
 
323 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  53.53 
 
 
337 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  55.26 
 
 
320 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  52.79 
 
 
318 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  53.72 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  51.83 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  51.99 
 
 
318 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 
337 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.6 
 
 
353 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 
325 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 
307 aa  238  9e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.51 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 
309 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  46.18 
 
 
304 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  56.36 
 
 
274 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  43.41 
 
 
330 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  38.8 
 
 
394 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  48.55 
 
 
361 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 
312 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  45.99 
 
 
309 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  43.98 
 
 
339 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  47.67 
 
 
333 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  46.51 
 
 
319 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  46.84 
 
 
316 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  46.52 
 
 
324 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  48.53 
 
 
284 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  47.83 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  40.65 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  48.73 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  68.21 
 
 
338 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
387 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 
312 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  41.07 
 
 
365 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  59.29 
 
 
434 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  58.57 
 
 
434 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  58.87 
 
 
422 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  58.16 
 
 
422 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  58.16 
 
 
422 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  58.16 
 
 
434 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  58.16 
 
 
434 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  57.45 
 
 
434 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  57.14 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  57.14 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  56.83 
 
 
426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.12 
 
 
419 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 
425 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.84 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.46 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.46 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  51.77 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.7 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 
421 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  49.25 
 
 
416 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 
425 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 
433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 
387 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  47.26 
 
 
382 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.19 
 
 
299 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  56.85 
 
 
357 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 
404 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 
394 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  52.86 
 
 
354 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  30.13 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  30.52 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  30.52 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.71 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  29.87 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.55 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.69 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  48.97 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.35 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  45.64 
 
 
346 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  30.92 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  30.71 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>