290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2100 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
369 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  91.76 
 
 
425 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  92.5 
 
 
421 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  89.52 
 
 
433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  74.3 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  57.23 
 
 
341 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  92.57 
 
 
404 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  92.47 
 
 
394 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  91.22 
 
 
416 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 
330 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.12 
 
 
419 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 
430 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  63.82 
 
 
362 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  36.87 
 
 
426 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  93.33 
 
 
387 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 
434 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  70.99 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  79.05 
 
 
330 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  80.77 
 
 
365 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  37.39 
 
 
308 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  48.15 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  70.3 
 
 
303 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  70.48 
 
 
304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 
357 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  40.41 
 
 
427 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  67.33 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  46.31 
 
 
309 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 
317 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  64.42 
 
 
312 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 
318 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  44.9 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  44.22 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  46.21 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  45.65 
 
 
317 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  49.63 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  46.04 
 
 
354 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  42.04 
 
 
306 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
309 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  51.69 
 
 
318 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 
325 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 
333 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  59.22 
 
 
309 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  56.73 
 
 
345 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  56.73 
 
 
434 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 
432 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  56.73 
 
 
332 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  55.77 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  51.24 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  51.24 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  50.41 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  44.76 
 
 
319 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 
338 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  54.81 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  52.29 
 
 
353 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  51.38 
 
 
355 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  42.22 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  43.07 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  41.11 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  59.83 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  41.43 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  43.7 
 
 
319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
299 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  58.97 
 
 
368 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  59.8 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  54.72 
 
 
318 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  55.34 
 
 
351 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  52.94 
 
 
316 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  55.77 
 
 
323 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  56.31 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  50 
 
 
337 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  51.92 
 
 
316 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
339 aa  92.8  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  52.94 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45334  zinc- and cadmium resistance protein  23.49 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  23.72 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.01 
 
 
312 aa  63.2  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  27.46 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
299 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.89 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.75 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.89 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.91 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.75 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.89 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.89 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.75 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>