More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4094 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  94.03 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  59.67 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  65.48 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  59.32 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  66.77 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  57.1 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  54.13 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  55.31 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  48.15 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  57.79 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  44.75 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  49.84 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  38.4 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  39.15 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  49.21 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  45.36 
 
 		 304 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  46.75 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.34 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  46.22 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  47.34 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  44.79 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  44.09 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  47.71 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  48.64 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  37.65 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  43.47 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  43.47 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  41.81 
 
 		 365 aa  208  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  46.51 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  72.73 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  50.17 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  47.62 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  47.63 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  41.53 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  43.97 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  46.82 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  45.55 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  49.46 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  46.57 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  46.43 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  64.49 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  45.42 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  63.24 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  43.93 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  45.1 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 		 433 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  57.14 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 434 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  55.81 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  54.76 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  53.97 
 
 		 427 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  53.97 
 
 		 422 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 		 422 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  53.17 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.71 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.3 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.2 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  28.2 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.6 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  29.05 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  29.05 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  27.06 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.95 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.61 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  34.63 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  30.56 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>