More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2351 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
325 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  91.89 
 
 
333 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  70.55 
 
 
317 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  71.71 
 
 
318 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  64.35 
 
 
332 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  66.88 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  66.12 
 
 
317 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  62.17 
 
 
318 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  63.69 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  56.69 
 
 
355 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  64.19 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  58.58 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  55.9 
 
 
337 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  55.28 
 
 
337 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  55.28 
 
 
337 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  58.47 
 
 
318 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  48.08 
 
 
325 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  54.17 
 
 
337 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 
308 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  62.59 
 
 
274 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  52.89 
 
 
368 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  44.58 
 
 
341 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  57 
 
 
315 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  54.9 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  52.87 
 
 
361 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  56.72 
 
 
315 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.35 
 
 
309 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 
425 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
421 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  47.39 
 
 
303 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  48.56 
 
 
330 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  47.88 
 
 
304 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  41.08 
 
 
394 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 
433 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  52.77 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  46.05 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  51.8 
 
 
309 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  52.96 
 
 
313 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  51.63 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.88 
 
 
353 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  44.84 
 
 
307 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  49.46 
 
 
284 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  45.72 
 
 
365 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  45.16 
 
 
309 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  44.44 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  47.3 
 
 
319 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  70.34 
 
 
345 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  48.89 
 
 
316 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  48.22 
 
 
319 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  68.97 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.06 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  68.28 
 
 
422 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  68.28 
 
 
422 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  67.13 
 
 
430 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 
324 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  65.73 
 
 
426 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  65.28 
 
 
434 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  63.89 
 
 
434 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  67.13 
 
 
427 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.87 
 
 
316 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  64.58 
 
 
434 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  63.89 
 
 
434 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  63.89 
 
 
434 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  62.76 
 
 
425 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  44.1 
 
 
339 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  48.39 
 
 
312 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  61.38 
 
 
419 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  63.12 
 
 
432 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 
362 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
394 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  49.38 
 
 
416 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  63.64 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
387 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  49.02 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 
398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 
351 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.09 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  54.69 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
305 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
387 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  33.23 
 
 
299 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 
369 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  27.91 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  33.97 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  27.91 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  27.91 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  48.53 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.71 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
315 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.46 
 
 
298 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 
299 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  32.44 
 
 
312 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.03 
 
 
312 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  30.03 
 
 
312 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>