More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1179 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  55.86 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  60.33 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  59.6 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  56.01 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  53.92 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  51.83 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  48.78 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  52.23 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  50.16 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  42.86 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  48.41 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  48.22 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  45.23 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  48.22 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  48.43 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.34 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  37.5 
 
 		 394 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  42.63 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  44.03 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  43.89 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  44.19 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 312 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  42 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  47.84 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  44.85 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  43.4 
 
 		 333 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  45.31 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  43.44 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  44.01 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  42.6 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  39.05 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  40.41 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  39.46 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  38.59 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  44.12 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  42.33 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  46.72 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  44.08 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  45.26 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  52.94 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 425 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  52.14 
 
 		 354 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 433 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  50 
 
 		 422 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  49.3 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  29.24 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  29.24 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  47.86 
 
 		 434 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 426 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.9 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  30.89 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  48.95 
 
 		 427 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  49.3 
 
 		 419 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 434 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.3 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.94 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  29.3 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  28.94 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  28.94 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 357 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  50.38 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  26.56 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  43.8 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  33.52 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  30.36 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>