More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1755 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  100 
 
 		 365 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  54.59 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  52.71 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  56.98 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  56.69 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  59.49 
 
 		 362 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  54.79 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  51.58 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  53.76 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 309 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.94 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  43.57 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  50.29 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  44.51 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  72.85 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  71.25 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  71.25 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  71.25 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  73.47 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  42.9 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  44.08 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  44.08 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  41.74 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  41.21 
 
 		 339 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  41.12 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  43.66 
 
 		 320 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  66.43 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  41.59 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  60.27 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  41.42 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  44.19 
 
 		 274 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  40.83 
 
 		 315 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  61.11 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  62.32 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  57.45 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  59.03 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  37 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  48.7 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  48.65 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  45.51 
 
 		 427 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  54.55 
 
 		 309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  48.28 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  41.07 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  41.07 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  50 
 
 		 422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 422 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  49.29 
 
 		 422 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  51.18 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  47.06 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  47.3 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  51.03 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  46.15 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.51 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  46.15 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  53.1 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  49.35 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  43.26 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  28.05 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  26.83 
 
 		 312 aa  107  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  28.25 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  28.25 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  28.25 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  54.29 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  26.63 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  23.69 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  25.88 
 
 		 315 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  23.71 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  27.5 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  27.19 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  26.81 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  26.2 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>