More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1792 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 323 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  71.02 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  73.08 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  67.18 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  70.19 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  69.35 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  65.29 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  67.95 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  67.53 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  64.97 
 
 		 333 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  66.04 
 
 		 320 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  58.72 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  59.87 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  60.52 
 
 		 318 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  54.08 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  54.08 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  65.37 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  54.15 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  55.42 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  53.8 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.58 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  55.37 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  50.79 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  53.89 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  54.52 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  44.81 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.04 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.15 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  46.96 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  53.82 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  47.95 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  48.89 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  41.58 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  51.58 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.45 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  44.89 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  49.52 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.88 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  49.85 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  49.54 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  49.23 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  37.47 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  45.22 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.21 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  44.58 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  46.75 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  42.95 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  64.83 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  49.53 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  64.83 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  69.44 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  65.56 
 
 		 430 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 		 426 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  68.75 
 
 		 422 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  68.79 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  68.75 
 
 		 422 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  64.83 
 
 		 434 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  62.25 
 
 		 425 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  64.14 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  64.14 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  60.93 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  62.14 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  63.83 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  54.86 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  62.76 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  54.69 
 
 		 354 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  49.65 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  46.9 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.48 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.32 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.32 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.32 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  31.67 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.67 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  27.13 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.25 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  26.5 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.21 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  34.75 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>