More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2772 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  53.5 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  58.74 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 421 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 		 425 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 		 433 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  41.97 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  56.83 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  51.28 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  46.15 
 
 		 394 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 394 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 416 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  51.37 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  62.59 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  52.03 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 		 387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  53.38 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  61.15 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  45.89 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  52.86 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  56.55 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  48.2 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.3 
 
 		 312 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  46.21 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  56.83 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  48.32 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  47.14 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  51.39 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  53.78 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 426 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  58.57 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  34.15 
 
 		 422 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.17 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  33.45 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  45.22 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  52.7 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  36.43 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 434 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.17 
 
 		 419 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 346 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  46.38 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  49.17 
 
 		 427 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  52.31 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  45.31 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  48.53 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  48.99 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  53.77 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  48.99 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  48.99 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  51.2 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 		 387 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  47.68 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  47.18 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  46.48 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  48.18 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.36 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  44.97 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.43 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  24.76 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.62 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  42.62 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.89 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>