More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0390 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  88.76 
 
 
422 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  88.76 
 
 
422 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  100 
 
 
427 aa  856    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  88.76 
 
 
422 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  72.33 
 
 
430 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  71.13 
 
 
426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.18 
 
 
419 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  60.63 
 
 
434 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  60.36 
 
 
434 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  60.63 
 
 
434 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  62.62 
 
 
425 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  59.91 
 
 
434 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  60.13 
 
 
434 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  57.44 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  85.53 
 
 
345 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  82.12 
 
 
337 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  82.12 
 
 
337 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  81.46 
 
 
337 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  69.78 
 
 
318 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  65.97 
 
 
332 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  64.08 
 
 
317 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 
333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 
325 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  65.28 
 
 
317 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  68.79 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  57.64 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  65.47 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  66.19 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  59.29 
 
 
318 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  65.81 
 
 
320 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  58.94 
 
 
338 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  53.19 
 
 
325 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 
368 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  56.67 
 
 
315 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 
357 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  53.9 
 
 
361 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 
309 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  51.45 
 
 
274 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  57.14 
 
 
308 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  51.75 
 
 
337 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 
421 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 
425 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  47.88 
 
 
394 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  58.16 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  55.12 
 
 
387 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.06 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  51.08 
 
 
303 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  50.71 
 
 
304 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 
404 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  46.43 
 
 
416 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  55.71 
 
 
315 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
341 aa  136  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  48.68 
 
 
330 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  51.33 
 
 
317 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 
369 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  51.15 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
312 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  52.34 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
307 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 
313 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 
339 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.75 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  44.97 
 
 
324 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  54.26 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  43.71 
 
 
354 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  53.17 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  51.33 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  42.76 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  50 
 
 
309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 
331 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  46.81 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 
382 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  48.36 
 
 
306 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 
312 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  41.3 
 
 
316 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43.06 
 
 
299 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  40.91 
 
 
390 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.87 
 
 
299 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.87 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 
299 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.21 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  37.41 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  37.41 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  37.41 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.11 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  40.31 
 
 
310 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
301 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  42.34 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  42.34 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  42.34 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  42.34 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>