More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5150 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  81.57 
 
 		 434 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  80.88 
 
 		 434 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  81.34 
 
 		 434 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 425 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  81.34 
 
 		 434 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  81.25 
 
 		 434 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  62.91 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  63.08 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  64.24 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  63.68 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  63.55 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  63.55 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  63.32 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  56.41 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  82.89 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  74.83 
 
 		 337 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  74.83 
 
 		 337 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  74.17 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  64.58 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  64.14 
 
 		 317 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 325 aa  183  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  65.52 
 
 		 317 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  56.85 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  66.19 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  62.25 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  57.62 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  60.71 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  62.25 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  54.42 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  60.43 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  54.68 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 325 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  51.75 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  51.08 
 
 		 274 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  48.94 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  48.59 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  45.68 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 330 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  47.77 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  51.33 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  51.18 
 
 		 312 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  54.29 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  54.68 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.56 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.89 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  57.04 
 
 		 313 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  43.07 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  46.36 
 
 		 333 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  47.86 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  49.01 
 
 		 309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  51.8 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  45.45 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  51.08 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.25 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  44.12 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  45.71 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.48 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 339 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  39.01 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  45.61 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 319 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  46.09 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  38.8 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.85 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.85 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.85 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  44.83 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  46 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  43.44 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  42.2 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.57 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.9 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.9 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.28 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>