More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1868 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 394 aa  795    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  94.55 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  89.42 
 
 		 416 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  85.18 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  71.86 
 
 		 425 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  74.77 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  70.09 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  77.49 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  63.17 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 		 330 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  89.03 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  47.81 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  41.76 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  44.85 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  46.99 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  77.85 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  79.17 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  74.15 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  42.44 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  71.25 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  70 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  63.83 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  60.96 
 
 		 312 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  39.71 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  63.83 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  55.94 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  43.2 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  49.66 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  57.03 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  50 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  56.35 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  52.52 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  54.33 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  51.59 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  53.54 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  52.23 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  47.52 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  51.75 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  53.17 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  44.83 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  52.52 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  52.14 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  52.7 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.79 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  51.43 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.05 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 318 aa  126  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  53.52 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.66 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  49.31 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  42.14 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  47.92 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  47.95 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  22.65 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45334  zinc- and cadmium resistance protein  22.81 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.83 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.63 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.48 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.29 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>