More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0891 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  56.58 
 
 		 284 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  45.16 
 
 		 325 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  50.33 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  45.58 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  45.6 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  46.41 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  49.04 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  46.98 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  41.59 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  48.89 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.3 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  44.33 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  45.87 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  43.23 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  45.06 
 
 		 323 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  46.33 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  42.22 
 
 		 330 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  47 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  46.33 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  46.6 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  45.64 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 		 333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  46.95 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  45.1 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  41.67 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  48.31 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  42.72 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  50 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  40.18 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  40.18 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  42.56 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  43.65 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  40.94 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  43.93 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 425 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  53.52 
 
 		 387 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 404 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 421 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 416 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  48.17 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  51.8 
 
 		 362 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 434 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  56.3 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.36 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  44.31 
 
 		 434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  44.31 
 
 		 434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 434 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  43.87 
 
 		 427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  51.77 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  44.53 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  48.55 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  52.71 
 
 		 422 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  51.94 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  51.94 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.31 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  27.92 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  43.07 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  53.54 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.29 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  35.95 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  27.18 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  47.3 
 
 		 430 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  47.3 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.21 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  30.41 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  28.47 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.29 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  28.62 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  28.62 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  50.78 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  31.96 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>