More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  100 
 
 
354 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  48.82 
 
 
353 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  49.86 
 
 
330 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
421 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  46.11 
 
 
307 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  47.66 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.44 
 
 
341 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 
433 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  52.17 
 
 
361 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  42.32 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 
368 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 
325 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  46.79 
 
 
332 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  52.49 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  45.61 
 
 
333 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  46.63 
 
 
355 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 
318 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 
369 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
309 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  50.29 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  48.93 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 
325 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  36.22 
 
 
387 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  47.72 
 
 
337 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  43.84 
 
 
308 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 
320 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  42.86 
 
 
274 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  62.2 
 
 
351 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  55.41 
 
 
324 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  40.75 
 
 
306 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  53.52 
 
 
316 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  48.95 
 
 
312 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  52.78 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  51.37 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  48.55 
 
 
404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  47.18 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
362 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.26 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  55.12 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  51.75 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  48.91 
 
 
346 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  47.33 
 
 
425 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  51.08 
 
 
309 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
434 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  48.32 
 
 
432 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
434 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  45.18 
 
 
427 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  49.67 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  46.31 
 
 
309 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 
434 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.4 
 
 
419 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 
337 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  44.37 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  49.61 
 
 
337 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  43.8 
 
 
304 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  54.36 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  57.14 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  27.58 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  43.59 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  57.14 
 
 
319 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 
318 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.39 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 
426 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  47.83 
 
 
422 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  55.38 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  47.1 
 
 
422 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 
422 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  53.47 
 
 
299 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  50 
 
 
315 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  27.27 
 
 
299 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  27.27 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  27.36 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.8 
 
 
299 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 
359 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  26.8 
 
 
299 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.8 
 
 
299 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  27.15 
 
 
299 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  27.15 
 
 
299 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.61 
 
 
299 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  26.8 
 
 
295 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  46.85 
 
 
317 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  28.53 
 
 
309 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.92 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  26.95 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
315 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  25.79 
 
 
306 aa  94  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  28.31 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>