More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3106 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  100 
 
 		 274 aa  530  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  97.48 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  63.27 
 
 		 332 aa  337  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  65.45 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  66.43 
 
 		 323 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  64.36 
 
 		 330 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  60.87 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  61.92 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  56.79 
 
 		 355 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  61.19 
 
 		 333 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  64.62 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  62.13 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  57.6 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  54.84 
 
 		 318 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.64 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 337 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 337 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  54.67 
 
 		 368 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  59.43 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  56.36 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  54.55 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  52.4 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  52.58 
 
 		 357 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  54.51 
 
 		 315 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  50.53 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  47.99 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.08 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  49.82 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  47.08 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.62 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  50.93 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  47.23 
 
 		 312 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  46.49 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  40.54 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  53.87 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  51.47 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  46.35 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  48 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  49.1 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  44.34 
 
 		 365 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  46.42 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.3 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  43.24 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  44.77 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  44.27 
 
 		 427 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  51.68 
 
 		 434 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  50.99 
 
 		 425 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  69.91 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 434 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  66.37 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  65.49 
 
 		 434 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  65.49 
 
 		 434 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  69.03 
 
 		 422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  64.6 
 
 		 419 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  68.14 
 
 		 422 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  68.14 
 
 		 422 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  67.26 
 
 		 430 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  65.49 
 
 		 426 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 		 432 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 		 425 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 		 421 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  59.82 
 
 		 433 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  36.87 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  59.82 
 
 		 404 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  59.82 
 
 		 394 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  58.93 
 
 		 387 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  58.93 
 
 		 416 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  61.95 
 
 		 338 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.45 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  58.41 
 
 		 354 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.32 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.32 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.31 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.32 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.94 
 
 		 398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  52.21 
 
 		 382 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.62 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  31.78 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  47.86 
 
 		 351 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  26.88 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  26.88 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>