More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1714 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 331 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  73.84 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  69.38 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  71.85 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  63.12 
 
 		 308 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  61.69 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  63.39 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  51.74 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  53.55 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  49.05 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  48.73 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  51.9 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  47.77 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  44.7 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  49.84 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  50.98 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.08 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  50.16 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  48.92 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  47.51 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  44.22 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  49.36 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  38.71 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  43.03 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  44.89 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  44.89 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  44.89 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  48.31 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 368 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  47.06 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  51.28 
 
 		 274 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 312 aa  219  7e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  44.55 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  45.22 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  42.09 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  46.2 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  41.1 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  44.55 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  43.93 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  41.46 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 434 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  51.43 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  53.1 
 
 		 433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  53.1 
 
 		 425 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  51.77 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  53.1 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  51.06 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  52.52 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.73 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  31.44 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.74 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.42 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.42 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.42 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  31.06 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  44.29 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  30.51 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.08 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.74 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  58.87 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  30.24 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.8 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  30.95 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.3 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.3 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.42 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.72 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  30.72 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.72 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>