More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0854 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 330 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  84.94 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  65.19 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  65.72 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  68.91 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  65.29 
 
 		 318 aa  362  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  63.9 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  64.22 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  59.18 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  61.95 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  65.19 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  56.83 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  57.73 
 
 		 318 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  57.37 
 
 		 337 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  57.05 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  57.05 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  62.98 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  56.19 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  44.12 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  54.1 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  52.42 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  48.44 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  54.43 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  49.55 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.66 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  42.5 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 425 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.16 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  45.43 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  43.96 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  50.69 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  50.61 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  51.76 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  44.69 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  36.83 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.24 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  44.79 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  45.11 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  45.36 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  47.2 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  49.36 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  46.06 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  46.37 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  69.06 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  47.52 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  66.67 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  47.99 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  65.96 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  65.96 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.12 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  64.03 
 
 		 434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  62.59 
 
 		 434 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  62.59 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  66.19 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 434 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 434 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  61.87 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  58.74 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  61.87 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  57.14 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  56.34 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  58.27 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.06 
 
 		 404 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  61.43 
 
 		 357 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  54.48 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  54.23 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  51.7 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  47.71 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.35 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  50 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  33.57 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.58 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.58 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.58 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  32.39 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  34.59 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  29.03 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  26.73 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  26.73 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>