More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0492 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  100 
 
 		 353 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  49.26 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  47.48 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  41.05 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 425 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  49.85 
 
 		 319 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  49.41 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.67 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  48.19 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  41.74 
 
 		 312 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  48.22 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  48.6 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  46.65 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  45.37 
 
 		 319 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  48.46 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  44.75 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  45.05 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  45.1 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  47.83 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  50.59 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  43.1 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  44.59 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  45.54 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  39.58 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  38.39 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  38.63 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  43.93 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  43.83 
 
 		 315 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 323 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  47.53 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  43.83 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  43.31 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  39.76 
 
 		 317 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  45.09 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  44.07 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  53.38 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  48.97 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  48.97 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  48.97 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  51.05 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  48.99 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 		 432 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  43.64 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  54.67 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  46.1 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  44.97 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  45.39 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  42.68 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  40.46 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  39.88 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.09 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  30.05 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.08 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.32 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  30.84 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.8 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  28.73 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>