More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1506 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  73.18 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  73.77 
 
 		 313 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  70.3 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  64.57 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  65.91 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  63.16 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  53.77 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  55.23 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  53.5 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  50.9 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  52.2 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  50.83 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  54.72 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  54.05 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  49.37 
 
 		 355 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  50.95 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  48.81 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.77 
 
 		 341 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  51.11 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  50.45 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  49.49 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  50.16 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  49.84 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  46.81 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  44.31 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  48.49 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  45.87 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  44.37 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  44.01 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 387 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  54.55 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 		 284 aa  222  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  43.9 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  48.14 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  45.31 
 
 		 333 aa  211  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  44.92 
 
 		 316 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  73.38 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  40.68 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  48.23 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  45.57 
 
 		 338 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  45.21 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  44.29 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  42.3 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  55.33 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  53.33 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  50.67 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  53.33 
 
 		 422 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  51.33 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  51.33 
 
 		 427 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  52.67 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  48 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  45.75 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  50.37 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  52.03 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 425 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40.72 
 
 		 421 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 		 433 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.95 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  48.28 
 
 		 394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  48.52 
 
 		 394 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  46.48 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  30.61 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.62 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  27.59 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  47.26 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  55.63 
 
 		 357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  27.24 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50.4 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.83 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  29.83 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.83 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  27.55 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  27.89 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  29.94 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.62 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>