More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3835 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  96.76 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  64.8 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  65.47 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  67.31 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  61.26 
 
 		 317 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  63.93 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  64.1 
 
 		 317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  64.22 
 
 		 333 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  57.83 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  62.91 
 
 		 318 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  51.45 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  57.28 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  56.39 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  58.31 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  54.14 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  54.1 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  53.05 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  52.65 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.47 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  52.23 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 		 341 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  47.13 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  45.25 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  45.63 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  45.92 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  49.34 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  53.11 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 		 312 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  44.34 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  50.63 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  39.56 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 284 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 394 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  44.66 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  47.81 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  47.15 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  43.92 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  45.89 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  42.25 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  42.55 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  69.72 
 
 		 422 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  62.58 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  69.01 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  69.01 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  43.83 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  62.59 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  65.75 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  64.38 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  66.9 
 
 		 427 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  65 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  59.35 
 
 		 425 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  46.39 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  63.01 
 
 		 432 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  58.11 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  54.29 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  54.29 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  52.86 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  54.29 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  56.49 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  35.68 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  50.68 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.44 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.91 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.77 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.9 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.77 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.77 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.65 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.75 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>