More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  93.08 
 
 		 319 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  60.33 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  63.02 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  58.88 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  65.37 
 
 		 312 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  57.48 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  54.37 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  57.79 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.6 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  45.81 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  49.06 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  38.1 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  50.65 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  36.83 
 
 		 425 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  44.19 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  47.65 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  47.63 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  46.47 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  46.83 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  43.35 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  41.78 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  45.22 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  48.14 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  40.4 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  73.43 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  49.49 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  48.37 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  46.84 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  41.81 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  45.18 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  42.77 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  43.93 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  46.96 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  33.25 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  46.72 
 
 		 284 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  48 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  47.06 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  65.94 
 
 		 382 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  44.55 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  44.59 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  44.69 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  61.76 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 421 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 433 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  57.14 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 434 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 434 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  51.8 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  56.59 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  54.76 
 
 		 422 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 		 422 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  53.97 
 
 		 422 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  53.17 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  51.43 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  29.87 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.47 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  28.62 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  52.71 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  29.15 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 398 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30.62 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  27.24 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 		 362 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  52.8 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  32.32 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.51 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  29.64 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>