More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2045 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  100 
 
 		 394 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  83.91 
 
 		 404 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  86.68 
 
 		 394 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  81.25 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  72.44 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  71.88 
 
 		 421 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  70.57 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  74.79 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  57.18 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  47.17 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  83.43 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  46.99 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  39.89 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  43.72 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  44.54 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  36.43 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  36.18 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  77.55 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  77.78 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  35.73 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  71.7 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  36.94 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  70 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  38.48 
 
 		 323 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  62.41 
 
 		 303 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  60.27 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  41.73 
 
 		 306 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  57.25 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  65.96 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  55.94 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  43.2 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  48.97 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  52.14 
 
 		 318 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  56.35 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  49.33 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  49.33 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  49.32 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  56.35 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  51.43 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  48.67 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  52.76 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  51.59 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  51.59 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  47.52 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  51.94 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  60.5 
 
 		 284 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  50.79 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  51.05 
 
 		 318 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  53.38 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  55 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  52.55 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  47.8 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  43.45 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.18 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  47.17 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  44.37 
 
 		 331 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  48.15 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  50.68 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  46.21 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  48.65 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  48.28 
 
 		 338 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  48.23 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  51.8 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 		 398 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  58.93 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  21.55 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45334  zinc- and cadmium resistance protein  23.38 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.51 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  32.61 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.43 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.23 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>