More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2230 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 346 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  44.68 
 
 		 421 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 425 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  49.7 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  43.83 
 
 		 433 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  46.81 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  48.8 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  46.43 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  47.34 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  45.8 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  47.83 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  42.51 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  48.72 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  48.27 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  42.44 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  45.24 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  41.62 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  40.65 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  45.27 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  42.64 
 
 		 309 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  40.12 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  40 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 317 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  42.81 
 
 		 315 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  43.28 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  41.83 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  40.77 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  41.32 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  38.64 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  35.22 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  41.44 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  40.54 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  38.55 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  40.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 		 351 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  41.56 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  42.63 
 
 		 274 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  40.52 
 
 		 313 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  60.87 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 422 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  30.9 
 
 		 422 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  30.66 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  39.53 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  38.99 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  53.96 
 
 		 312 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  48.61 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  56.52 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  43.56 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  34.69 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.25 
 
 		 419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  40.24 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  46.53 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  26.47 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  26.51 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  25.52 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  26.88 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  26.17 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  26.14 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  26.17 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  26.14 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  26.17 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  26.17 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 325 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  26.14 
 
 		 312 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 325 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  25.17 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  25.17 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>