More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5056 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  95.35 
 
 		 430 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 426 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  72.55 
 
 		 419 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  71.83 
 
 		 422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  71.6 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  71.36 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  71.6 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  63.11 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  61.95 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  61.95 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  62.18 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  63.21 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  61.02 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  59.43 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  89.47 
 
 		 345 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  82.78 
 
 		 337 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  82.78 
 
 		 337 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  82.12 
 
 		 337 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  64.58 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  67.63 
 
 		 318 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  64.08 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  66.19 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  66.19 
 
 		 325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  66.91 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  66.19 
 
 		 318 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  55.56 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  60 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  63.52 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  52 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  57.86 
 
 		 338 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  58.99 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0472  cation diffusion facilitator family transporter  54.41 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  53.68 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  53.68 
 
 		 361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  57.14 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.52 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  45.18 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  49.06 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  56.85 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  50.94 
 
 		 394 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  50.35 
 
 		 274 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.86 
 
 		 362 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  50.67 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  55.12 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  52.76 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  51.8 
 
 		 309 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 		 394 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  54.29 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  49.29 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  51.08 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  46.05 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  50.76 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  47.86 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  54.68 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  44.97 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 		 351 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  47.86 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  53.57 
 
 		 331 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  53.17 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  52.71 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  46.81 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  41.72 
 
 		 354 aa  113  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  41.73 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  52.71 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  41.89 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  51.33 
 
 		 284 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  40.4 
 
 		 316 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  42.64 
 
 		 310 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.17 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.17 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.17 
 
 		 312 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  46.08 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  44.44 
 
 		 313 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  44.44 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  43.7 
 
 		 313 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  35.56 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  40.17 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.81 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>