68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3645 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  78.06 
 
 		 353 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  75 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  68.18 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  68.18 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  66.38 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  58.99 
 
 		 377 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  64.61 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  59.02 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  56.28 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  53.12 
 
 		 377 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  54.21 
 
 		 375 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  54.6 
 
 		 371 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  51.44 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  43.69 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.22 
 
 		 300 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  68.42 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.24 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.24 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  66.67 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.24 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.24 
 
 		 294 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  61.72 
 
 		 285 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  63.41 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  66.38 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.55 
 
 		 253 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.6 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  62.6 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.6 
 
 		 274 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  62.6 
 
 		 179 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  72.73 
 
 		 80 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  43.65 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  43.65 
 
 		 434 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 434 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 434 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.12 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 425 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  43.93 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  42.99 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  40.87 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  42.39 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  42.39 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  42.39 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  39.18 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  39 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  57.63 
 
 		 69 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  30.28 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  42.53 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.04 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  36.84 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  37 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  27.1 
 
 		 208 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  27.27 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  53.33 
 
 		 230 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  33.64 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  35.11 
 
 		 543 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  34.07 
 
 		 438 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  30.4 
 
 		 417 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  36.71 
 
 		 506 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2096  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31030  putative cation efflux system protein  31.94 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000427913  unclonable  4.33311e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 531 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  25.71 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  30.61 
 
 		 509 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3869  cobalt-zinc-cadmium resistance protein (cation efflux system protein)  28.71 
 
 		 432 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>