64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0085 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 371 aa  755    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  59.08 
 
 		 373 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  57.45 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  57.68 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  59.46 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  59.78 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  56.18 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  56.37 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  56.18 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  53.44 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  55.62 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  57.26 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  55.69 
 
 		 323 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  52.81 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  52.51 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  79.85 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  77.78 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  71.97 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  71.97 
 
 		 294 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  71.97 
 
 		 282 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  77.97 
 
 		 274 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  77.97 
 
 		 274 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  75.42 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  75.42 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  75.42 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  74.58 
 
 		 274 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  78.33 
 
 		 179 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  71.55 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  55.56 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  60.28 
 
 		 253 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  77.78 
 
 		 80 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  30.17 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  59.32 
 
 		 69 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  39.18 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  30.28 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  30.17 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  39.64 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  31.54 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  41.46 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  33.61 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  37.31 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  38.78 
 
 		 230 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.43 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  33.65 
 
 		 501 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  27.93 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  28.12 
 
 		 239 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  33.6 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  33.6 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  28.95 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3869  cobalt-zinc-cadmium resistance protein (cation efflux system protein)  28.97 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  28.77 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  29.84 
 
 		 543 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  31.9 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  26.32 
 
 		 249 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  32.98 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  20.14 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>