40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0849 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  99.44 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  99.44 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  99.44 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  97.21 
 
 		 274 aa  300  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  85.26 
 
 		 285 aa  297  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  74.86 
 
 		 274 aa  254  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  74.86 
 
 		 274 aa  254  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  71.12 
 
 		 282 aa  248  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.34 
 
 		 294 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  66.33 
 
 		 294 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.78 
 
 		 300 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  68.49 
 
 		 323 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  57.76 
 
 		 377 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  50.53 
 
 		 289 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  60 
 
 		 376 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  68.49 
 
 		 371 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  63.12 
 
 		 371 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  62.94 
 
 		 372 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  52.85 
 
 		 292 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  57.14 
 
 		 376 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  50.28 
 
 		 253 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  55.48 
 
 		 373 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  66.13 
 
 		 377 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  63.71 
 
 		 375 aa  157  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  61.74 
 
 		 390 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  57.32 
 
 		 398 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  61.65 
 
 		 354 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  53.09 
 
 		 356 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  59.15 
 
 		 353 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  55 
 
 		 69 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  36.63 
 
 		 543 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  35.11 
 
 		 506 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  39.53 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  34.78 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  35.87 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  41.07 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  35.16 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  34.09 
 
 		 793 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  30.88 
 
 		 293 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>