67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3242 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  99.66 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  95.24 
 
 		 282 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  91.16 
 
 		 274 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  91.16 
 
 		 274 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  74.49 
 
 		 274 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  77.89 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  73.13 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  73.47 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  73.47 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  67.66 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  57.43 
 
 		 292 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.8 
 
 		 289 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  52.43 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  67.34 
 
 		 179 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  77.97 
 
 		 371 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  68.46 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  61.29 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  61.04 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  57.96 
 
 		 377 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  57.89 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  58.55 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  59.46 
 
 		 372 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  55.13 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  59.86 
 
 		 377 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  62.31 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  68.14 
 
 		 398 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  56.3 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  64.91 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  84.81 
 
 		 80 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  46.67 
 
 		 356 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  29.27 
 
 		 543 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  28.68 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  26.44 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  40.62 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  56.67 
 
 		 69 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.45 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  34.48 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  30.1 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  36.46 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  23.16 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  24.3 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  35.92 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  37.5 
 
 		 439 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  30.19 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  24.65 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.54 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  22.65 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  20.73 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  26.42 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  20.33 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  21.62 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  23.13 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  26.27 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  28.36 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  29.24 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  23.88 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  28.65 
 
 		 358 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  26.38 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  28.65 
 
 		 356 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  22.43 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  28.65 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  28.65 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 		 1148 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  28.65 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>