25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1851 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 231 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  84.91 
 
 		 232 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  46.96 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  36.8 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  45.53 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  34.76 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  31.82 
 
 		 208 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  32.16 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  29.46 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  30.63 
 
 		 208 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  30.56 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  26.18 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  29.65 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  25.49 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  25.45 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  25.89 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  35.81 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  27.31 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  26.91 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1474  hypothetical protein  56 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2044  hypothetical protein  29.09 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.150592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  25.52 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  29.36 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  29.23 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>