53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0110 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  40.38 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  29.36 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  35.53 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.34 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  35.82 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  29.49 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  28.05 
 
 		 207 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  36.36 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  28.89 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  25.65 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  29.03 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  28.43 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  25.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  24.11 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  23.96 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2044  hypothetical protein  28.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.150592  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  25.26 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  29.73 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  22.6 
 
 		 340 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  25.76 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  31.21 
 
 		 347 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  37.61 
 
 		 337 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  30.6 
 
 		 347 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  30.6 
 
 		 347 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  34.83 
 
 		 352 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  30.6 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  34.44 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  24.62 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  30.33 
 
 		 336 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  31.73 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  29.51 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  26.09 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  44.9 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  29.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  29.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  29.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  29.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  29.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  21.39 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  38.16 
 
 		 339 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  35.53 
 
 		 464 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  29.68 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  33 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  28.16 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  25.32 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  24.35 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  26.42 
 
 		 350 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  32.47 
 
 		 352 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  32.47 
 
 		 352 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  32.47 
 
 		 352 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>