69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0628 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  100 
 
 		 357 aa  705    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  57.31 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  54.77 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  54.22 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  54.22 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  54.22 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  54.18 
 
 		 464 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  52.57 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  52.57 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  52.57 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  52.57 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  52.57 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  57.83 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  55.59 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  53.67 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  55.9 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  52.55 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  54.17 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  54.66 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0344  high-affinity nickel-transporter  57.14 
 
 		 371 aa  331  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  54.17 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  52 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  53.59 
 
 		 426 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  53.59 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  53.59 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  53.59 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  53.59 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  50.45 
 
 		 342 aa  326  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  52.8 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  53.11 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  52.85 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  52.85 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  51.67 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  54.6 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  54.29 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  53.36 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  53.65 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  55.82 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  55.82 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  56.12 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  49.24 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  47.14 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  47.14 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  47.83 
 
 		 378 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  44.94 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  43.34 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  47.24 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  47.47 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  42.14 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  42.86 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  39.32 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  38.34 
 
 		 340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  38.98 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  38.75 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  49.61 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  42.16 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  38.28 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  36.42 
 
 		 445 aa  182  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  44.27 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01630  conserved hypothetical protein  41.42 
 
 		 536 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  38.35 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  39.09 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  35.64 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  30.3 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  29.8 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  28.22 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  55.32 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  28.22 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  34.38 
 
 		 246 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>