67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1533 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 278 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  68.03 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  37.38 
 
 		 238 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  37.38 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  33.2 
 
 		 341 aa  92.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  28.97 
 
 		 340 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4471  High-affinity nickel permease-like protein  29.66 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.0258472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  36.06 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  33.65 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  34.88 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  32.57 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  29.19 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  32.04 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  30.54 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  35 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  28.36 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  34.63 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 336 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  33.17 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  32.04 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  34.31 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  31.68 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  34.31 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  33.66 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  33.99 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  33.99 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  33.66 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  33.99 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  33.5 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  33.5 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  31.53 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  33.5 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  33.82 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  34.63 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  35.86 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  32.02 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  33.33 
 
 		 445 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  30.85 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  33.17 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  30.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  30.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  30.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01630  conserved hypothetical protein  31.8 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  30.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  32.5 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  31.03 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  31.03 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  30.58 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  32.51 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  35 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  32.21 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  28.71 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  31.03 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  28.23 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  28.23 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  31.03 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  28.23 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  29.24 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  30.58 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  33.75 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  33.75 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  35.11 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  31.25 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  28.05 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  30.24 
 
 		 363 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  30.1 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  27.54 
 
 		 357 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>