57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4471 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4471  High-affinity nickel permease-like protein  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.0258472 
 
 
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NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  30.33 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  27.74 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  29.32 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  29.84 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  28 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  29.96 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  23.31 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  23.29 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  25 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  25 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  25 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  25 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  25 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  26.15 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  26.26 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  25.97 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  27.68 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
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NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  28.77 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  23.65 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  26.29 
 
 		 352 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  26.79 
 
 		 352 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  22.84 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  28.21 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
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NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  24.49 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  25.5 
 
 		 378 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  27.36 
 
 		 464 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  24.11 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  28.43 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  28.43 
 
 		 347 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  26.15 
 
 		 347 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  27.36 
 
 		 434 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  27.36 
 
 		 434 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  28.43 
 
 		 347 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  27.36 
 
 		 426 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  27.36 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  27.36 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  27.36 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  27.36 
 
 		 353 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  27.41 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
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NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  25.77 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  26.9 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  24.26 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  24.87 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  27.19 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
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NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  23.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  23.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  29.25 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  23.5 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  27.72 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  24.26 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  27.45 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
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NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  28.11 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
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NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  28.1 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  24.09 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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