67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2353 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 336 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  42.73 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  42.73 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  42.29 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  38.99 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  47.15 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  48.78 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  44.07 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  44.59 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  45.9 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  40.34 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  38.99 
 
 		 464 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  39.8 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  43.39 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  41.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  41.28 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  39.2 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  39.2 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  41.28 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  41.28 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  41.28 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  41.28 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  45.27 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  45.27 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  40 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  43.86 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  39.14 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  46.09 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  38.58 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  44.66 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  44.88 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  43.05 
 
 		 375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  44.27 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  44.03 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  35.51 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  35.16 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  40.4 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  42.8 
 
 		 364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  36.42 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  36.11 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
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NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  36.11 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  36.11 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  36.11 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  34.49 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
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NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  34.49 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  34.49 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  44.49 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
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NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  43.02 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  43.31 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0344  high-affinity nickel-transporter  37.42 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  43.5 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
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NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  40.95 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1305  high-affinity nickel-transporter  41.13 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.827623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  38.83 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  42.06 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0248  high-affinity nickel-transporter  39.93 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  40.41 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  41.2 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  34.69 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
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CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  34.07 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0397  high-affinity nickel-transporter  36.24 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  38.24 
 
 		 445 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
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NC_006684  CNB01630  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 		 536 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3945  high-affinity nickel-transporter  36.07 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1533  high-affinity nickel-transporter  32.8 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.0243743 
 
 
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NC_006368  lpp2542  hypothetical protein  30.5 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2397  hypothetical protein  30.5 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
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