64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3973 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  100 
 
 		 189 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  64.46 
 
 		 134 aa  148  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  51.69 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  42.39 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  68.09 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0768  high-affinity nickel-transporter  70.21 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5194  high-affinity nickel-transporter  53.23 
 
 		 388 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4638  high-affinity nickel-transporter  62.5 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2124  high-affinity nickel-transporter  56.25 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  61.22 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  59.18 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  59.18 
 
 		 338 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3077  high-affinity nickel-transporter  63.83 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1139  high-affinity nickel-transporter  55.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3562  high-affinity nickel transport protein  55.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112076  normal  0.0177752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1085  high-affinity nickel transport protein  55.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2023  high-affinity nickel permease  55.32 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0628  high affinity nickel transporter transmembrane protein  55.32 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 347 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 347 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0765  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2778  high-affinity nickel-transporter  47.69 
 
 		 350 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2721  high-affinity nickel-transporter  47.69 
 
 		 350 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3358  high-affinity nickel-transport protein  60.42 
 
 		 364 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06115  nickel transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08830)  52.08 
 
 		 445 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2353  high-affinity nickel-transporter  61.7 
 
 		 336 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0532549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3184  high-affinity nickel-transporter  51.06 
 
 		 342 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0344  high-affinity nickel-transporter  60.42 
 
 		 371 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  58.33 
 
 		 328 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2895  high-affinity nickel transport protein  53.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3082  high-affinity nickel transport protein  53.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2926  high-affinity nickel transport protein  53.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2962  high-affinity nickel transport protein  53.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  hitchhiker  0.000151942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2979  high-affinity nickel transport protein  53.19 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  53.19 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2409  high affinity nickel transporter  50 
 
 		 464 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0073389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  67.35 
 
 		 374 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0881  high affinity nickel transporter  50 
 
 		 434 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  50 
 
 		 364 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0279  putative high-affinity nickel-transport protein  50 
 
 		 434 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0285868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2258  high-affinity nickel-transporter  48.94 
 
 		 303 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  51.06 
 
 		 343 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0350  high-affinity nickel-transporter  52.08 
 
 		 331 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1617  high-affinity nickel transport protein  50 
 
 		 426 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2096  high affinity nickel transporter  50 
 
 		 376 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1952  high-affinity nickel transport protein  50 
 
 		 353 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1936  high-affinity nickel transport protein  50 
 
 		 353 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1172  high affinity nickel transporter  50 
 
 		 353 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0268855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  53.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1993  hydrogenase nickel incorporation  32.24 
 
 		 375 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1584  high-affinity nickel-transporter  45.83 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0403124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03490  high-affinity nickel-transporter, HoxN/HupN/NixA family  50 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1574  high-affinity nickel-transporter  43.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0038  high-affinity nickel transporter  52.38 
 
 		 354 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  51.06 
 
 		 362 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  51.02 
 
 		 336 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2412  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 140 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5876  high-affinity nickel-transporter  47.92 
 
 		 354 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0629  high-affinity nickel-transporter  48.94 
 
 		 357 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.349464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0975  high-affinity nickel-transporter  46.94 
 
 		 363 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.025287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  48.94 
 
 		 352 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>