25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3876 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 232 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  84.91 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  49.57 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  35.09 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  35.47 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  44.18 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  32 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  28.76 
 
 		 207 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  31.28 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  27.62 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  26.52 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  26.07 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  25.11 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  30.09 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1474  hypothetical protein  52.24 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  28.63 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  42.24 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.150592  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  23.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  26.61 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>