44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001366 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  100 
 
 		 323 aa  664    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  55.25 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  49.85 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  51.76 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  50.29 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  45.98 
 
 		 377 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  48.77 
 
 		 376 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  49.39 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  48.68 
 
 		 398 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  47.37 
 
 		 371 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  46.3 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  47.58 
 
 		 390 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  44 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  43.69 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  43.08 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  69.06 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  69.06 
 
 		 294 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  72.87 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  72.31 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  72.31 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  68.35 
 
 		 282 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  72.8 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  73.39 
 
 		 274 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  73.39 
 
 		 274 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  73.39 
 
 		 274 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  73.39 
 
 		 179 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.44 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  65.87 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  56.29 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  51.68 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  58.33 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  77.27 
 
 		 80 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  31.68 
 
 		 447 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  35.79 
 
 		 208 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  36.96 
 
 		 208 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  39.33 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  36.27 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  33.91 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  32.61 
 
 		 506 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  44 
 
 		 439 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  39.44 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  30.12 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  28.45 
 
 		 434 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  30.12 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>