84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1910 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 439 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  45.36 
 
 		 506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  39.43 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  35.81 
 
 		 543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.88 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  30.87 
 
 		 208 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  34.32 
 
 		 358 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.53 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.39 
 
 		 208 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.15 
 
 		 274 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  30.77 
 
 		 274 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.77 
 
 		 274 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  28.87 
 
 		 292 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  32.13 
 
 		 227 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.84 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.57 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.38 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.57 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  29.13 
 
 		 208 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  33.2 
 
 		 230 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.17 
 
 		 282 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  39.29 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.91 
 
 		 253 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.89 
 
 		 294 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.89 
 
 		 294 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  31.12 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  33.62 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  39.2 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  38.05 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  24.61 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  40 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  25.68 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  34.85 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  24.89 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  28.04 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  36.27 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  27.57 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  25.82 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  25.82 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  25.82 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  26.69 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  23.85 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  27.1 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  34.59 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  23.38 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  26.92 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  31.3 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  38.38 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  20.52 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  35.4 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  23.74 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.74 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.74 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  36.78 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  23.19 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  28.81 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 329 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  21.74 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  35.23 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  20.15 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  21.65 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  22.89 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 249 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  37.5 
 
 		 80 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  23.05 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.58 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  41.76 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  24.07 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  24.9 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  22.27 
 
 		 238 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  21.22 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  21.22 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  20.79 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  20.76 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  27.37 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  23.91 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  23.26 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4926  hypothetical protein  25.95 
 
 		 268 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  23.19 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  30.38 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  24.19 
 
 		 330 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  21.77 
 
 		 239 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  26.29 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  22.59 
 
 		 372 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>