44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6802 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 543 aa  1050    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  37.8 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  35.84 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  34.77 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  32.75 
 
 		 447 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.32 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.92 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.94 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.94 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  30.18 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  25.27 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.14 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.5 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.27 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.5 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  27.27 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.97 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.84 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.17 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  39.74 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  32.37 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.74 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  38.04 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  37.65 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  31.08 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  31.78 
 
 		 208 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  37.93 
 
 		 353 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  31.47 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.92 
 
 		 340 aa  50.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  24.92 
 
 		 340 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.92 
 
 		 340 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  42.86 
 
 		 230 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  35.63 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  29.91 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  34.48 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  34.69 
 
 		 323 aa  47  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  26.43 
 
 		 390 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  38.03 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  27.61 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  24.79 
 
 		 208 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  40.38 
 
 		 377 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  25.47 
 
 		 208 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>