69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0687 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 208 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  89.9 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  86.06 
 
 		 208 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  30.95 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  29.19 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  28.7 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.06 
 
 		 274 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.06 
 
 		 274 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.66 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.24 
 
 		 282 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  25.41 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.41 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25 
 
 		 274 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  32.56 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  34.48 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.37 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  38.04 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  31.96 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  35.23 
 
 		 356 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  34.48 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  27.32 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  26.38 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  27.42 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  32.95 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  43.55 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  28.12 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  30.28 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  29.47 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  28.12 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  40.62 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  29.35 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  22.22 
 
 		 372 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  29.63 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  25.14 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  39.29 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  24.02 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  44.23 
 
 		 80 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  29.13 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  22.71 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  40.74 
 
 		 372 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  40.74 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  42.59 
 
 		 501 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  26.74 
 
 		 376 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  27.11 
 
 		 438 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  21.59 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  23.67 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  35.79 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  34.78 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  23.67 
 
 		 328 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  23.19 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  23.19 
 
 		 328 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  23.19 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.03 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.27 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  21.03 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  21.05 
 
 		 345 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  20.08 
 
 		 337 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  22.64 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  23 
 
 		 289 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  22.28 
 
 		 330 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.31 
 
 		 227 aa  42  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  27.37 
 
 		 359 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>