62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0559 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 398 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  56.62 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  60.48 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  55.7 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  58.89 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  54.83 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  55.65 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  51.54 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  53.87 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  52.65 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  51.44 
 
 		 353 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  50.39 
 
 		 354 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  53.68 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  48.4 
 
 		 356 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  48.68 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  66.67 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.89 
 
 		 285 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  58.24 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  65.87 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  66.4 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  66.4 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  66.4 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  66.94 
 
 		 179 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  70.59 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.79 
 
 		 282 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.02 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.02 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.02 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  62.02 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  60.5 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  72.15 
 
 		 80 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  44.21 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1104  hypothetical protein  54.24 
 
 		 69 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  41.8 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  29.47 
 
 		 208 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  30.43 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  28.26 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  36.79 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  30.07 
 
 		 543 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  34.55 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  33.98 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  51.11 
 
 		 230 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  31.25 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.51 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  32.94 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  25.34 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  32.56 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  32.56 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  29 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  36.73 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  31 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  22.94 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>